Protein–RNA interactions for Protein: Q5M775

SPECC1, Cytospin-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1Q5M775 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SPECC1Q5M775 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SPECC1Q5M775 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SPECC1Q5M775 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms