Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC4

CT47A1, Cancer/testis antigen 47A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47A1Q5JQC4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CT47A1Q5JQC4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CT47A1Q5JQC4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms