Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC178Q5BJE1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC178Q5BJE1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms