Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PKDCCQ504Y2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKDCCQ504Y2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKDCCQ504Y2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms