Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TPRNQ4KMQ1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TPRNQ4KMQ1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
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