Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0U5

CFAP221, Cilia- and flagella-associated protein 221, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP221Q4G0U5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP221Q4G0U5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP221Q4G0U5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms