Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q1T7F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Q1T7F1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Q1T7F1 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Q1T7F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms