Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CCDC142Q17RM4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCDC142Q17RM4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms