Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTPRNQ16849 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRNQ16849 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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