Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TBR1Q16650 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
TBR1Q16650 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TBR1Q16650 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
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