Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ZNF239Q16600 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ZNF239Q16600 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ZNF239Q16600 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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