Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALX1Q15699 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALX1Q15699 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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