Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIP13Q15645 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP13Q15645 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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