Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ELOBQ15370 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms