Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GBX1Q14549 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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GBX1Q14549 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GBX1Q14549 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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