Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PEX6Q13608 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PEX6Q13608 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
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