Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRR1Q13601 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KRR1Q13601 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms