Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
C1orf61Q13536 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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