Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ATRQ13535 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ATRQ13535 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
ATRQ13535 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ATRQ13535 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATRQ13535 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATRQ13535 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATRQ13535 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATRQ13535 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
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