Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRPC3Q13507 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRPC3Q13507 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRPC3Q13507 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms