Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TOP3AQ13472 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TOP3AQ13472 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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