Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SNTA1Q13424 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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SNTA1Q13424 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SNTA1Q13424 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
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