Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MSLNQ13421 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MSLNQ13421 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
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