Protein–RNA interactions for Protein: Q13409

DYNC1I2, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1I2Q13409 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
DYNC1I2Q13409 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
DYNC1I2Q13409 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms