Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
AP3B2Q13367 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AP3B2Q13367 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AP3B2Q13367 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
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