Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 RABGEF1-211ENST00000503687 4139 ntTSL 210.1□□□□□ -0.797e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.87e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.961e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.961e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-221ENST00000449610 1673 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.961e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.971e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.981e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 RABGEF1-209ENST00000607882 2654 ntTSL 28.87□□□□□ -0.997e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 KLF3-202ENST00000482150 517 ntTSL 28.81□□□□□ -17e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-207ENST00000416707 1260 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.031e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-219ENST00000446860 1565 ntTSL 2 BASIC8.6□□□□□ -1.031e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-210ENST00000431721 2174 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.091e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-220ENST00000449563 580 ntTSL 48.17□□□□□ -1.11e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-203ENST00000412795 750 ntTSL 38□□□□□ -1.131e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-209ENST00000424035 568 ntTSL 47.73□□□□□ -1.171e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-214ENST00000436134 631 ntTSL 37.73□□□□□ -1.171e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-222ENST00000450045 689 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.181e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-224ENST00000454335 631 ntTSL 47.68□□□□□ -1.181e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-206ENST00000413654 553 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-213ENST00000434860 560 ntTSL 47.64□□□□□ -1.191e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-225ENST00000455545 539 ntTSL 37.61□□□□□ -1.191e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-216ENST00000440424 537 ntTSL 46.97□□□□□ -1.291e-10■□□□□ 11.1
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SRSF9Q13242 IP6K2-208ENST00000417896 1124 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.31e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-204ENST00000412850 543 ntTSL 46.45□□□□□ -1.381e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 UBE2D2-208ENST00000511725 656 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.397e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 CA5A-203ENST00000568801 506 ntTSL 26.05□□□□□ -1.447e-6■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-215ENST00000437427 576 ntTSL 45.6□□□□□ -1.511e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 IP6K2-217ENST00000443853 579 ntTSL 35.6□□□□□ -1.511e-10■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ASPSCR1-203ENST00000344865 1041 ntTSL 213.83□□□□□ -0.22e-25■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 ASPSCR1-209ENST00000581484 1001 ntTSL 210.66□□□□□ -0.72e-25■□□□□ 11.1
SRSF9Q13242 HGD-201ENST00000283871 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 HGD-204ENST00000475447 565 ntTSL 35.33□□□□□ -1.565e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 HGD-210ENST00000494453 683 ntTSL 35.33□□□□□ -1.565e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 HGD-209ENST00000492108 631 ntTSL 24.7□□□□□ -1.665e-10■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-216ENST00000486066 546 ntTSL 412□□□□□ -0.492e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-214ENST00000482805 608 ntTSL 410.23□□□□□ -0.772e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-210ENST00000461684 677 ntTSL 49.86□□□□□ -0.832e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 CHRD-213ENST00000482014 560 ntTSL 49.76□□□□□ -0.852e-9■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.631e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-212ENST00000498355 1936 ntTSL 218.1■□□□□ 0.491e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.421e-7■□□□□ 11
SRSF9Q13242 LEMD2-202ENST00000421671 2323 ntTSL 316.35■□□□□ 0.211e-10■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-10■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.161e-10■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC8.37□□□□□ -1.071e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)6.8□□□□□ -1.321e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-203ENST00000610585 903 ntTSL 36.72□□□□□ -1.331e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)4.56□□□□□ -1.681e-6■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 PNN-204ENST00000554902 583 ntTSL 23.61□□□□□ -1.835e-15■□□□□ 10.9
SRSF9Q13242 PLEC-211ENST00000527303 598 ntTSL 313.54□□□□□ -0.244e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.764e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.784e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.824e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.844e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.854e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-205ENST00000356346 14683 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.854e-8■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.934e-8■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.224e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.134e-10■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.224e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 FUS-206ENST00000487509 4920 ntTSL 212.19□□□□□ -0.464e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-210ENST00000555412 572 ntTSL 28.55□□□□□ -1.045e-10■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 FUS-211ENST00000568901 521 ntTSL 26.52□□□□□ -1.374e-10■□□□□ 10.8
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SRSF9Q13242 SRSF5-204ENST00000553548 526 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.435e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-218ENST00000557435 622 ntTSL 25.8□□□□□ -1.485e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-219ENST00000557460 939 ntTSL 55.74□□□□□ -1.495e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.65e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-208ENST00000584437 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.592e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.762e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-203ENST00000577716 4367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 RNF43-207ENST00000583753 3560 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.062e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 SNHG3-202ENST00000437681 2614 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.182e-10■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 LAMA5-208ENST00000474128 579 ntTSL 310.73□□□□□ -0.697e-7■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.193e-19■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 PPM1G-202ENST00000472077 3752 ntTSL 26.86□□□□□ -1.313e-19■□□□□ 10.8
SRSF9Q13242 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.641e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.711e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.1-205ENST00000451919 654 ntTSL 39.87□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.2-203ENST00000434893 403 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.1-203ENST00000438858 543 ntTSL 39.19□□□□□ -0.941e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.1-204ENST00000458554 438 ntTSL 38.74□□□□□ -1.011e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 AP000347.2-201ENST00000423913 584 ntTSL 56.98□□□□□ -1.291e-6■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-220ENST00000531393 2304 ntTSL 1 (best)14.59□□□□□ -0.071e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-212ENST00000528770 2233 ntTSL 213.58□□□□□ -0.241e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.31e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-225ENST00000533816 540 ntTSL 512.34□□□□□ -0.431e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-202ENST00000524474 907 ntTSL 211.65□□□□□ -0.541e-17■□□□□ 10.7
SRSF9Q13242 EPS8L2-217ENST00000530452 704 ntTSL 311.4□□□□□ -0.581e-17■□□□□ 10.7
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