Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPA4Q13156 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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