Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 ERBIN-206ENST00000503913 544 ntTSL 35.94□□□□□ -1.464e-9■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 USP32-208ENST00000589335 691 ntTSL 519.79■□□□□ 0.764e-8■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 USP32-207ENST00000588898 578 ntTSL 512.27□□□□□ -0.454e-8■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 USP32-202ENST00000393003 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.644e-8■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 USP32-210ENST00000589761 430 ntTSL 210.38□□□□□ -0.754e-8■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 USP32-211ENST00000590133 2563 ntTSL 29.83□□□□□ -0.844e-8■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.31e-12■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 BMP1-209ENST00000518913 2663 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.015e-7■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 BMP1-211ENST00000520970 4333 ntTSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.145e-7■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 BMP1-210ENST00000520626 3925 ntTSL 1 (best)12.57□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 BMP1-212ENST00000520982 3244 ntTSL 1 (best)12.56□□□□□ -0.45e-7■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.86e-7■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 SYMPK-202ENST00000593504 5107 ntTSL 214.7□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 SYMPK-215ENST00000600237 5164 ntTSL 514.2□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.412e-7■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 TRAF7-206ENST00000569686 586 ntTSL 225.4■■□□□ 1.661e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.381e-6■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 318.65■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.123e-8■■■■■ 30.8
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TARDBPQ13148 CCAR1-215ENST00000543229 2475 ntTSL 26.23□□□□□ -1.415e-8■■■■■ 30.7
TARDBPQ13148 CCAR1-213ENST00000541012 2432 ntTSL 1 (best)5.78□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 30.7
TARDBPQ13148 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.55e-8■■■■■ 30.7
TARDBPQ13148 CCAR1-203ENST00000479143 478 ntTSL 55.4□□□□□ -1.545e-8■■■■■ 30.7
TARDBPQ13148 CCAR1-211ENST00000539539 3224 ntTSL 24.17□□□□□ -1.745e-8■■■■■ 30.7
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TARDBPQ13148 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.118e-7■■■■■ 30.7
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TARDBPQ13148 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 KMT2E-203ENST00000334884 6840 ntTSL 514.35□□□□□ -0.114e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 KMT2E-212ENST00000482560 1759 ntTSL 55.67□□□□□ -1.54e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 CD46P1-201ENST00000441364 763 ntBASIC9.63□□□□□ -0.876e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 CR1L-205ENST00000531844 663 ntTSL 28.07□□□□□ -1.126e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 DCAF6-212ENST00000491067 536 ntTSL 34.36□□□□□ -1.711e-17■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.78e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.218e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 ARID4B-205ENST00000421364 5151 ntTSL 1 (best)11.81□□□□□ -0.528e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 ARID4B-212ENST00000491632 3823 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.658e-7■■■■■ 30.6
TARDBPQ13148 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 30.5
TARDBPQ13148 CPED1-209ENST00000520801 553 ntTSL 411.55□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 30.5
TARDBPQ13148 CPED1-208ENST00000495036 2198 ntTSL 1 (best)10.93□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 30.5
TARDBPQ13148 RPL11-202ENST00000443624 994 ntTSL 27.81□□□□□ -1.163e-11■■■■■ 30.5
TARDBPQ13148 DAP-205ENST00000510546 780 ntTSL 217.32■□□□□ 0.366e-10■■■■■ 30.5
TARDBPQ13148 IGF2BP3-214ENST00000492771 564 ntTSL 412.06□□□□□ -0.486e-7■■■■■ 30.5
TARDBPQ13148 FLJ46284-203ENST00000521230 407 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 30.4
TARDBPQ13148 FLJ46284-202ENST00000521148 496 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.223e-7■■■■■ 30.4
TARDBPQ13148 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.177e-7■■■■■ 30.4
TARDBPQ13148 RBM38-201ENST00000342690 852 ntTSL 321.3■■□□□ 17e-7■■■■■ 30.4
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