Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PDZK1IP1Q13113 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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PDZK1IP1Q13113 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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PDZK1IP1Q13113 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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PDZK1IP1Q13113 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PDZK1IP1Q13113 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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PDZK1IP1Q13113 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PDZK1IP1Q13113 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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