Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIK2Q13002 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIK2Q13002 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
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