Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CNTN1Q12860 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNTN1Q12860 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
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