Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KCNH2Q12809 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KCNH2Q12809 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
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