Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY1Q0D2K3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms