Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
EGR3Q06889 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EGR3Q06889 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms