Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAD51Q06609 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAD51Q06609 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms