Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GABPB1Q06547 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms