Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPARDQ03181 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPARDQ03181 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPARDQ03181 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms