Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MUC3AQ02505 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
MUC3AQ02505 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MUC3AQ02505 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms