Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
OTUD4Q01804 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
OTUD4Q01804 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTUD4Q01804 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms