Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZBED6P86452 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZBED6P86452 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms