Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX4P78413 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX4P78413 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX4P78413 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IRX4P78413 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
IRX4P78413 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX4P78413 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX4P78413 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX4P78413 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IRX4P78413 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX4P78413 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX4P78413 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
IRX4P78413 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
IRX4P78413 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX4P78413 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX4P78413 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX4P78413 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX4P78413 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
IRX4P78413 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms