Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN10P78369 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN10P78369 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms