Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBB4BP68371 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBB4BP68371 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBB4BP68371 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms