Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SUMO1P63165 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SUMO1P63165 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms