Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBA52P62987 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA52P62987 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA52P62987 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBA52P62987 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBA52P62987 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBA52P62987 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBA52P62987 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBA52P62987 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBA52P62987 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBA52P62987 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
UBA52P62987 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms