Protein–RNA interactions for Protein: P62424

RPL7A, 60S ribosomal protein L7a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL7AP62424 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPL7AP62424 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPL7AP62424 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms