Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SUMO2P61956 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SUMO2P61956 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms