Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
ARF3P61204 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARF3P61204 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARF3P61204 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARF3P61204 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ARF3P61204 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARF3P61204 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARF3P61204 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARF3P61204 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF3P61204 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF3P61204 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF3P61204 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARF3P61204 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF3P61204 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARF3P61204 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ARF3P61204 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ARF3P61204 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARF3P61204 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARF3P61204 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARF3P61204 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ARF3P61204 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARF3P61204 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ARF3P61204 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ARF3P61204 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ARF3P61204 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms