Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FBXW4P57775 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
FBXW4P57775 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms