Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRPF1P55201 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRPF1P55201 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms